Sihtasutuse tegevust kavandab nõukogu. Nõukogu korraldab ka Sihtasutuse juhtimist ja teostab järelevalvet selle tegevuse üle. Nõukogu koosseisu võib kuuluda kuni 13 liiget, kes määratakse asutaja poolt kolmeks aastaks.
Nõukogu koosseisus muudatuste tegemise ning nõukogu liikmete tagasikutsumise otsustab asutaja. Nõukogu nõusolek on juhatusele vajalik tehingute tegemiseks, mis väljuvad igapäevase majandustegevuse raamidest. Oma ülesannete täitmiseks on nõukogul õigus tutvuda kõigi Sihtasutuse dokumentidega ning kontrollida raamatupidamise õigsust, varade olemasolu, samuti Sihtasutuse tegevuse vastavust seadusele ja põhikirjale.
Integratsiooni Sihtasutuse nõukogu koosseis (kinnitatud 05.07.2024):
Eda Silberg – nõukogu esimees, Kultuuriministeeriumi kultuurilise mitmekesisuse asekantsler
Volitused kehtivad 25.08.2022 kuni 24.08.2025; nõukogu esimehe kuutasu 210 eurot (bruto).
Henry Kattago – nõukogu aseesimees, Haridus- ja Teadusministeeriumi asekantsler
Volitused kehtivad 02.06.2023 kuni 01.06.2026; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Aleksei Jašin – Eesti 200 esindaja
Volitused kehtivad 02.06.2023 kuni 01.06.2026; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Andrus Tamm – Keskerakonna esindaja
Volitused kehtivad 02.06.2023 kuni 01.06.2026; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Birute Klaas-Lang – Tartu Ülikooli eesti keele võõrkeelena professor
Volitused kehtivad 30.06.2024 kuni 29.06.2027; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Georg Männik – Isamaa Erakonna esindaja
Volitused kehtivad 05.01.2023 kuni 04.01.2026; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Henri Kaselo – Sotsiaaldemokraatliku Erakonna esindaja
Volitused kehtivad 05.01.2023 kuni 04.01.2026; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Kalle Viks – Rahandusministeerium
Volitused kehtivad 25.06.2023 kuni 24.06.2026; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Mari-Liis Jakobson – Tallinna Ülikooli poliitikasotsioloogia dotsent
Volitused kehtivad 30.06.2024 kuni 29.06.2027; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Maris Toomel – Jõhvi Vallavanem, Eesti Reformierakonna esindaja
Volitused kehtivad 30.06.2024 kuni 29.06.2027; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Mart Kallas – Eesti Konservatiivse Rahvaerakonna esindaja
Volitused kehtivad 05.07.2024 kuni 04.07.2027; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
Tarmo Miilits – Siseministeeriumi kantsler
Volitused kehtivad 09.03.2022 kuni 08.03.2025; nõukogu liikme kuutasu 140 eurot (bruto).
